Durante una missione su un pianeta, il Colonnello Sheppard viene catturato dai Genii, mentre gli altri componenti della squadra riescono a tornare su Atlantide. Il nuovo capo dei Genii, Ladon arriva su Atlantis e si dichiara ignaro di quello che è accaduto a Sheppard ma non viene creduto e viene trattenuto dalle forze di sicurezza. Nel frattempo Sheppard è prigioniero in un rifugio Genii e si trova nuovamente alle prese con il comandante Kolya, che non ha rinunciato alla sua vendetta nei confronti dei terrestri e ha una sorpresa in serbo per il colonnello.
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| Titolo Originale | Common Ground |